AI热持续发酵,领军企业Tempus再出手与 TCR-T龙头企业TScan达成合作
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原创 AI热持续发酵,领军企业Tempus再出手与 TCR-T龙头企业TScan达成合作
张博闻
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2023-9-14

2023年7月10日/医麦客新闻 eMedClub News/--近日,人工智能(AI)和精准医学领域领导者Tempus与TCR-T前沿企业TScan Therapeutics达成伴随诊断(CDx)测试,此次合作支持TScan的1期实体瘤TCR-T细胞疗法的临床试验筛选方案,该方案旨在根据肿瘤抗原阳性和完整的HLA表达,为患者提供定制的TCR-Ts混合物。

 

 

 

TCR分子属于免疫球蛋白,依赖于与MHC分子的相互作用。MHC是一组在细胞表面表达的蛋白,可以结合胞内短肽并且递呈到细胞表面,在人类中MHC被称作HLA,而HLA是一种具有高度多态性的同种异体抗原,是机体免疫系统识别的主要同种异体抗原。在不同患者之中,HLA分子的差异很大,除了同卵双胞胎外,人群中几乎没有完全相同的HLA,导致了TCR-T细胞疗法需要针对不同的患者进行定制。

 

▲ 图片来源:TScan官网

在第37届癌症免疫治疗学会(SITC)年会上,TScan的首席科学家和运营官Gavin MacBeath博士就曾表示“TCR-T疗法治疗实体瘤的最大挑战是靶标异质性和HLA丢失的问题”。因此TScan与Tempus达成合作,使用xT检测Tempus的648基因组合,前瞻性地识别肿瘤中丢失HLA的患者,以选择识别患者肿瘤中仍然完整的HLA基因的TCR-T。

 

Tempus的xT平台

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2023年5月1日,xT-CDx上市前批准(PMA)申请被美国FDA通过,作为囊括着648个基因实体肿瘤二代测序产品,用于微卫星不稳定状态检测和结肠癌患者伴随诊断,可以帮助医生为患者提供个性化诊疗,并支持研究人员开发更好的治疗方法。

早在2019年,xT平台能增加癌症患者的个性化治疗机会已被证实。Tempus在2019年的《NATURE》上发表了“Integrated genomic profiling expands clinical options for patients with cancer”,该研究侧重于由Tempus xT平台分析的不同肿瘤类型的500名患者样本,发现这些患者与基于深度分子分析和临床数据管理的广泛疗法和试验相匹配。

 

 

▲ 图片来源:NATURE

Tempus xT平台的功能是强大的,因为它集成了对每位患者结构化临床数据的分析,以及来自肿瘤/正常匹配DNA测序、全转录组RNA测序和免疫生物标志物测量的分子数据。同行评议研究的一些关键发现包括:

●Dna测序数据的使用可让92%的患者与各级治疗证据层支持的精准治疗相匹配。其中,30%的患者与靶向治疗相匹配,并得到了共识指南或良好把握度研究的高水平临床证据的支持。

●随着RNA测序和免疫疗法生物标志物结果的增加,这一匹配疗法的数量增加到43%。

●结合xT平台测量的临床数据和生物标志物,77%的患者至少匹配了一项相关的临床试验选择。

●使用肿瘤正常(种系)测序数据大大提高了突变鉴定的准确性。


Tempus在配对肿瘤正常样本和临床数据的基因组分析方面处于领先地位,以发现可以为治疗决策提供信息的独特见解,可以根据患者的基因组和临床数据,将其与治疗和临床试验相匹配。

 

Tempus与医药龙头的合作,推动生物医药发展

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科学技术是第一生产力,这句话已影响到了越来越多的领域,人工智能(AI)与生物医药强强联手定将会迸发出强大的潜力,目前已有多家机构企业向AI抛出橄榄枝,寻求互利共赢的新合作。

 

2018年,FDA先后与CancerLinQ LLC、Concerto HealthAI和Tempus等科技公司达成合作,以了解免疫检查点抑制剂的实际用途、耐受性和有效性。这些公司对真实世界患者接受免疫检查点抑制剂的数据进行分析,并将结果提交给美国FDA。

 

2021年9月,Tempus与阿斯利康合作,将提供大量的去识别化的数据和相应的人工智能分析工具,以发现新的药物靶点并将其开发成可用于试验的疗法。

 

2021年12月1日,Tempus宣布扩大其与杨森Janssen的多年期协议,扩大的范围以基于人工智能的新工作为基础,利用AI/ML和真实世界证据(RWE)加强肿瘤学适应症疗法的发现和开发以及Janssen参与Tempus的TIMETrial®Network,以加速患者在某些生物标记物驱动的试验中的入组。该协议利用Tempus的人工智能能力,共同创建算法,旨在进一步为特定的癌症适应症(包括生物标记物选择的队列)进行患者预筛选工作。Tempus的多学科团队的专业知识跨越了临床RWE、计算生物学、软件工程、机器学习和试验匹配项目管理,是成功利用人工智能方法进行试验招募的一个关键因素。

 

2022年10月,Tempus宣布与英国葛兰素史克(GSK)签署了一项为期三年的协议。这项合作使GSK能够访问Tempus的人工智能平台和Tempus的去识别化患者数据库。通过其领先的人工智能和机器学习能力,GSK将与Tempus合作,改善临床试验设计,加快入组速度并确定药物靶点。这将有助于提高GSK的研发成功率,并为患者提供更多个性化的治疗。

 

2023年03月05日,Tempus与辉瑞达成为期多年的战略合作,两家公司将携手推动AI和机器学习驱动的癌症治疗开发。合作过程中,辉瑞可访问Tempus的人工智能平台及多模态数据库,更精准地整合信息,为抗癌新药发现和开发提供参考。辉瑞还可以借助Tempus的平台,支持研发,包括AI驱动的辅助诊断和Tempus临床试验匹配计划TIME,该计划可快速启动全国范围内患者临床研究。

 

结语
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当前基于人工智能(AI)的算法也越来越多地应用在生物医药研发的关键阶段,AI可以促进发现新的靶点机制,并能协助开发新的疾病治疗模型(比如类器官、高通量),实现了大数据的精准分析,成为癌症治疗开发中不可或缺的重要信息储备。这也要求了生物技术和电子科技、数学统计学等学科之间进行跨学科合作,也需要相关部门与高校储备积极培养更多的专业人才。相信时代的滚滚洪流向前,定能将生物制药领域领域带入AI合作的新纪元!

   

参考资料:

1.https://www.biospace.com

2.https://www.tempus.com

3.https://www.tscan.com

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